El Gomera FS es el máximo representante en deportes de equipo de la Isla. El  club compite en la máxima categoría del fútbol sala en Canarias, Grupo Canario de la Segunda División B, desde la temporada 2004/05. 

En estos casi veinte años, el Gomera FS se ha proclamado campeón de la  categoría en 5 ocasiones, disputando los playoffs de ascenso a la División de  Plata del fútbol sala nacional. Además, el club colombino, ha jugado la Copa del  Rey en 8 ocasiones, protagonizando un hito histórico para el deporte gomero 
enfrentándose al FC Barcelona en el año 2013. 

Actualmente el club no dispone de jugadores gomeros suficientes para  configurar una plantilla de garantías que permita participar en la categoría  nacional con solvencia. Año tras año, la entidad asiste a una diáspora constante de canteranos. Los jugadores abandonan la Isla por diferentes motivos y dejan  de competir con el equipo de su tierra. 

La competición es muy exigente, por lo que la falta de jugadores se convierte en  un inconveniente insalvable para poder competir de la manera que estamos  acostumbrados. Por ello, el club valora no competir antes que abandonar sus  principios y su filosofía, que no es otra, que competir con jugadores de la casa. 

Los principios del proyecto deportivo han sido siempre claros y firmes. El objetivo  es garantizar la permanencia del fútbol sala de alto nivel en la Isla y crecer desde  abajo. Para ello se trabaja en la creación de una Escuela de fútbol sala, que  contendrá equipos desde la categoría benjamín hasta la categoría cadete, y que  se pondrá en marcha a partir del mes de septiembre del presente año.